Envolto en misticismo, a historia do Santuario da Barca vincúlase directamente coa aparición da Santa neste lugar. Conta a lenda que aquí, nun momento de desazón, o Apóstolo Santiago recibiu o alento da Virxe María. Apareceuse ante el, chegando nunha barca de pedra guiada por anxos, para infundirlle novas forzas na súa misión evanxelizadora.
Deste episodio, quedaron os restos da embarcación que varou na costa, como se dun signo divino se tratase. A materialización deste milagre atópase nas coñecidas como pedras sanadoras localizadas nos arredores do templo e que foron veneradas durante varios séculos.
Son tres elementos únicos: a Pedra dos Cadrís (a vela), a Pedra de Abalar (o casco) e a Pedra do Timón. Dende tempos ancestrais, estas pedras foron lugares de culto e se lles atribúen propiedades máxicas, especialmente relacionadas coa fertilidade. Son a conexión viva entre a fe, a natureza e a historia.
A lenda da Virxe da Barca foi contada de xeración en xeración, tecendo un tapiz de simbolismo e devoción que impregna cada recuncho deste lugar. De feito, xa no século XV, un nobre polaco chamado Nicolás de Popielovo deixou constancia do seu asombro ao ver en Muxía “un barco esnaquizado, feito de pura pedra cun mastro e unha vela colgada, ambos de pedra”. A fe na Virxe da Barca transcendía fronteiras!
